Skeletal muscle specific signalling pathways

Выделение скоординировано регулируемых групп генов (кластеров) в скелетных мышцах крыс при атрофической разгрузке и реадаптации

Кластеры скоординированно регулируемых генов определялись по экспрессии их промоторов при помощи алгоритма “китайского ресторана” (Qin, 2006), реализованного в платформе BioUML.

Данные по каждому типу мышц (m. soleus и m. extensor digitorum longus) анализировали независимо.

В результате было выделено по 15 кластеров скоординированно регулируемых генов (табл. 1.3). Для получения статистически значимых результатов в анализ включали кластеры размером не менее 100 генов.