Difference between revisions of "Skeletal muscle specific signalling pathways"
From Muscle
(Created page with "==Выделение скоординировано регулируемых групп генов (кластеров) в скелетных мышцах крыс при ат...") |
|||
Line 2: | Line 2: | ||
Кластеры скоординированно регулируемых генов определялись по экспрессии их промоторов при помощи алгоритма “китайского ресторана” (Qin, 2006), реализованного в платформе BioUML. | Кластеры скоординированно регулируемых генов определялись по экспрессии их промоторов при помощи алгоритма “китайского ресторана” (Qin, 2006), реализованного в платформе BioUML. | ||
− | Данные по каждому типу мышц (m. soleus и m. extensor digitorum longus) анализировали независимо. | + | Данные по каждому типу мышц (''m. soleus'' и ''m. extensor digitorum longus'') анализировали независимо. |
− | В результате было выделено по 15 кластеров скоординированно регулируемых генов (табл. 1.3). Для получения статистически значимых результатов в анализ включали кластеры размером не менее 100 генов. | + | В результате было выделено по 15 кластеров скоординированно регулируемых генов (табл. [https://docs.google.com/spreadsheets/d/1HVFyQMhkqD4O79QVm6VImcsGKFvs2h04sSMjquNAJ94/edit?usp=sharing 1.3]). Для получения статистически значимых результатов в анализ включали кластеры размером не менее 100 генов. |
Revision as of 13:30, 5 March 2021
Выделение скоординировано регулируемых групп генов (кластеров) в скелетных мышцах крыс при атрофической разгрузке и реадаптации
Кластеры скоординированно регулируемых генов определялись по экспрессии их промоторов при помощи алгоритма “китайского ресторана” (Qin, 2006), реализованного в платформе BioUML.
Данные по каждому типу мышц (m. soleus и m. extensor digitorum longus) анализировали независимо.
В результате было выделено по 15 кластеров скоординированно регулируемых генов (табл. 1.3). Для получения статистически значимых результатов в анализ включали кластеры размером не менее 100 генов.